Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM35Q9UPQ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms