Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHORDC1Q9UHD1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms