Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms