Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCHIP1Q9P0W5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms