Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms