Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZDHHC3Q9NYG2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZDHHC3Q9NYG2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms