Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERINC1Q9NRX5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SERINC1Q9NRX5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms