Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCDHB16Q9NRJ7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms