Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP1Q9C000 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms