Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms