Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms