Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAGR1Q9BTK6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms