Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTKNQ9BST9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms