Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GORASP1Q9BQQ3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GORASP1Q9BQQ3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms