Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms