Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DCHS1Q96JQ0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms