Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ROPN1LQ96C74 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ROPN1LQ96C74 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms