Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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