Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC2Q6ZN30 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNC2Q6ZN30 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms