Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NHLRC1Q6VVB1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms