Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms