Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms