Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC9A4Q6AI14 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms