Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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