Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYCP1Q15431 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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