Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD3Q15054 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD3Q15054 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms