Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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