Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRDM2Q13029 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms