Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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