Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFCP2Q12800 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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