Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms