Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPEQ02224 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPEQ02224 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPEQ02224 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPEQ02224 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms