Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms