Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms