Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRISP1P54107 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms