Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX2-5P52952 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms