Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTGDSP41222 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGDSP41222 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms