Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB4P30926 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNB4P30926 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms