Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms