Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO1P25800 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO1P25800 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO1P25800 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO1P25800 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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