Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRZ1P23471 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms