Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSPP15924 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSPP15924 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSPP15924 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DSPP15924 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms