Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHGAP10645 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHGAP10645 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms