Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI2P10070 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI2P10070 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI2P10070 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GLI2P10070 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GLI2P10070 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI2P10070 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI2P10070 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI2P10070 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms