Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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