Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KIAA0556O60303 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms