Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCBPO00560 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms