Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3C2AO00443 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms