Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NOTOA8MTQ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms