Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms